Cent Eur J Public Health 2015, 23(1):69-72

Norovirus Infection in Belarus: Occurrence and Molecular Epidemiology

Natallia Uladzimirauna Paklonskaya1, Tamara Vasil'evna Amvrosieva1, Kanstantsin Leanidavich Dziadziulia1, Natallia Mikalaeuna Baranouskaya1, Elena Petrovna Kishkurno2, Nina Leonidovna Kluiko3
1 Republican Research and Practical Centre for Epidemiology and Microbiology, Minsk, Belarus
2 Belarusian Medical Academy of Post-Graduate Education, Minsk, Belarus
3 City Children's Clinical Hospital of Infectious Diseases, Minsk, Belarus

The objective of the study is to analyze molecular epidemiologic surveillance for norovirus infection in Belarus over the past five years (2009-2013). Laboratory diagnostics was carried out by RT-PCR in 684 patients. Two regions of norovirus genome, localized in RNA-polymerase and capsid protein genes, were used for phylogenetic analysis. Noroviruses were predominant causative agents in adults and second only to rotaviruses in children, they also prevailed among aetiological agents of outbreaks (66.7% of outbreaks). In 2009-2013, the major norovirus genotype was GII.4 (58.3% of all genotyped isolates). Genovariant GII.4 2006b circulated in 2009 and 2010, genovariant GII.4 2009 New Orleans - in 2010 and 2012. In addition to GII.4, genotypes GII.6 (16.6%), GII.2 (4.1%), GII.3 (2.2%), and recombinant genotypes GII.g-GII.12 and GII.g-GII.1 (10.4% and 8.3%, respectively) circulated in Belarus. The findings indicate a significant contribution of noroviruses in development of sporadic morbidity and outbreaks of acute gastroenteritis in Belarus. Outbreaks or prominent increases of sporadic morbidity were mostly due to the emergence of a new genotype, or an epidemic genovariant.

Klíčová slova: norovirus, acute gastroenteritis, group and sporadic morbidity, genotype

Vloženo: 26. květen 2014; Revidováno: 9. prosinec 2014; Přijato: 9. prosinec 2014; Zveřejněno: 1. březen 2015  Zobrazit citaci

ACS AIP APA ASA Harvard Chicago Chicago Notes IEEE ISO690 MLA NLM Turabian Vancouver
Paklonskaya NU, Amvrosieva TV, Dziadziulia KL, Baranouskaya NM, Kishkurno EP, Kluiko NL. Norovirus Infection in Belarus: Occurrence and Molecular Epidemiology. Cent Eur J Public Health. 2015;23(1):69-72. PubMed PMID: 26036102.
Stáhnout citaci

Reference

  1. Zheng DP, Ando T, Fankhauser RL, Beard RS, Glass RI, Monroe SS. Norovirus classification and proposed strain nomenclature. Virology. 2006 Mar 15;346(2):312-23. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  2. Lopman BA, Reacher MH, Van Duijnhoven Y, Hanon FX, Brown D, Koopmans M. Viral gastroenteritis outbreaks in Europe, 1995-2000. Emerg Infect Dis. 2003 Jan;9(1):90-6. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  3. Widdowson MA, Monroe SS, Glass RI.Are noroviruses emerging? Emerg Infect Dis. 2005 May;11(5):735-7. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  4. Patel MM, Widdowson MA, Glass RI, Akazawa K, Vinjé J, Parashar UD. Systematic literature review of role of noroviruses in sporadic gastroenteritis. Emerg Infect Dis. 2008 Aug;14(8):1224-31. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  5. Victoria M, Miagostovich MP, Ferreira MS, Vieira CB, Fioretti JM, Leite JP, et al. Bayesian coalescent inference reveals high evolutionary rates and expansion of Norovirus populations. Infect Genet Evol. 2009 Sep;9(5):927-32. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  6. Lindesmith LC, Donaldson EF, Baric RS. Norovirus GII.4 strain antigenic variation. J Virol. 2011 Jan;85(1):231-42. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  7. Vinjé J, Vennema H, Maunula L, von Bonsdorff CH, Hoehne M, Schreier E, et al. International collaborative study to compare reverse transcriptase PCR assays for detection and genotyping of noroviruses. J Clin Microbiol. 2003 Apr;41(4):1423-33. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  8. Kojima S, Kageyama T, Fukushi S, Hoshino FB, Shinohara M, Uchida K, et al. Genogroup-specific PCR primers for detection of Norwalk-like viruses. J Virol Methods. 2002 Feb;100(1-2):107-14. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  9. Yan H, Yagyu F, Okitsu S, Nishio O, Ushijima H. Detection of norovirus (GI, GII), Sapovirus and astrovirus in fecal samples using reverse transcription single-round multiplex PCR. J Virol Methods. 2003 Dec;114(1):37-44. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  10. Altschul SF, Gish W, Miller W, Myers EW, Lipman DJ. Basic local alignment search tool. J Mol Biol. 1990 Oct 5;215(3):403-10. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  11. Tamura K, Stecher G, Peterson D, Filipski A, Kumar S. MEGA6: Molecular Evolutionary GeneticsAnalysis version 6.0. Mol Biol Evol. 2013 Dec;30(12):2725-9. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  12. Felsenstein J. Confidence limits on phylogenies: an approach using the bootstrap. Evolution. 1985;39(4):783-91. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  13. Bull RA, White PA. Mechanisms of GII.4 norovirus evolution. Trends Microbiol. 2011 May;19(5):233-40. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  14. Eden JS, Hewitt J, Lim KL, Boni MF, Merif J, Greening G, et al. The emergence and evolution of the novel epidemic norovirus GII.4 variant Sydney 2012. Virology. 2014 Feb;450-451:106-13. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  15. Vega E, Vinjé J. Novel GII.12 norovirus strain, United States, 2009-2010. Emerg Infect Dis. 2011 Aug;17(8):1516-8. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...
  16. Hoffmann D, MauroyA, Seebach J, Simon V, Wantia N, Protzer U. New norovirus classified as a recombinant GII.g/GII.1 causes an extended foodborne outbreak at a university hospital in Munich. J Clin Virol. 2013 Sep;58(1):24-30. Přejít k původnímu zdroji... Přejít na PubMed...